トレントのアプリやダウンロードしたファイルは、すぐに削除したほうがいいですか？

勝手にデータを消去・初期化することはおすすめしません。PCなどに残っているトレントの通信ログやダウンロードファイルは、IPアドレスの誤判別や身に覚えのない請求を受けた際、「反論するための重要な証拠」となり得ます。意図的な証拠隠滅と疑われるリスクもあるため、まずはソフトの起動（アップロード）のみを停止し、そのままの状態で弁護士にご相談ください。